对于human而言,主流的DNA甲基化芯片有450K和850K两种,这两个数字代表覆盖到的甲基化位点的个数,是一个约数 甲基化芯片上混合使用了I 型探针和II 型探针,I 型探针通过两个bead type 分别识别甲基化的C和非甲基。

可选的甲基化芯片产品就少很多,绝大部分是illumina公司产品的,从27K到450K到850K甲基化芯片比较好的介绍是Illumina 琪先生 20180717的 一文了解 MethylationEPIC 850K 甲基化芯片 Infinium MethylationEPIC BeadC。

和甲基化有关的 可以先了解下甲基化 450k甲基化基础 450K甲基化芯片数据处理传送门 450k甲基化芯片常用工具包ChAMP和minfi等甲基化的一些预备知识 甲基化程度的量化 DMP或DML,差异甲基化位点。