1、2二代测序对于DNA来讲，目前的主要应用为tn5转座酶的文库构建，还有用来研究DNA与蛋白研究互作的CHIPseq，以及wes或者wgs测序等对于RNA的建库就很多了，比如mRNAseq，lncRNAseq，circRNAseq，miRNAseq，或者是全。

2、转录组即某个物种或特定细胞在某一功能状态下产生的所有RNA包括mRNA，smallRNA及noncoding RNA等的总和转录组测序是指利用第二代高通量测序技术进行cDNA测序，全面快速地获取某一物种特定器官或组织在某一状态下的几乎。

3、基因组以生物体所有的核酸为研究对象，狭义的基因组定义为生命体的全套DNA，广义的基因组则包含DNAmRNAlncRNA等参与到基因表达调控的所有核酸序列其主要研究手段为基因测序，以华大基因为代表转录组通常可认为是基因。

4、问14芯片数据两分类，每组20个样本，能否每组单独做WGCNA？ 答可以WGCNA还有一种重要功能是做两个网络的比较，比如病人20个样本做一个调控网络，健康人做一个调控网络，然后两个网络做比较 问15WGCNA可以用来分析lncRNA对下游基因的。

5、3 CHIPqPCR 研究细胞在转染shRNA或对照后，分别采用RA处理后H3K56Ac结合的lncRNA和基因细胞经处理后进行CHIP，利用H3K56Ac抗体沉淀复合物，然后分离纯化复合物内核酸，使用预测的引物检测lncRNA或基因富集适用于研究或。

6、调控机理研究理论上会涉及多个层面的因素，例如转录因子蛋白激酶miRNADNA甲基化组蛋白修饰lncRNA 转录因子成为调控机理的研究大户是最正常不过的事情因为一个转录因子能同时控制多个基因的表达，同时转录因子的功能作用也可能。