数据库名称GEO数据库 网址 功能由NCBI创建并维护,收录全球范围内的基因表达数据,包括微阵列芯片二代测序等高通量数据GEO分为GEO DataSets和GEO Profiles,前者存储数据集,后者关注基因表达谱提供在线分析工具GEO2R,支持数据集和基因的差异分析数据库名称ArrayExpress。

7 医学相关数据挖掘课程,不用做实验也能发文章,学习链接 TCGA差异基因分析 GEO芯片数据挖掘 GSEA富集分析课程 TCGA临床数据生存分析 TCGA转录因子分析 TCGAceRNA调控网络分析 8其他课程链接 二代测序转录组数据自主分析 NCBI数据上传 二代测序数据解读。

LncRNA还能通过ceRNA机制,与miRNA竞争性结合,影响下游靶基因的表达量此外,一些LncRNA能够编码小肽,参与细胞生命活动LncRNA研究常用数据库可以查询到基因信息亚细胞定位SNP位点编码能力及相关疾病等信息LncRNA研究方案包括LncRNA靶点筛选功能研究和机制研究,通过生物信息学分析RNAseq和芯片。